1)Une prise de distance
En 2005 sort Metal Gear Solid 3 : Snake Eater. A l’origine, Kojima ne devait pas réaliser cet épisode, déléguant la tâche à ses équipes. N’étant pas satisfait des premiers prototypes du jeu, il décide de revenir aux manettes du projet, afin que sa vision du sujet soit parfaitement retranscrite. Avec ce volet, il s’agit alors pour Kojima de « corriger » le faux pas Metal Gear Solid 2 : Sons of Liberty. En 2006, Kojima produit Metal Gear Solid : Portable Ops sur PSP, suite directe de Metal Gear Solid 3 : Snake Eater. La réalisation du jeu est confiée à Masahiro Yamamoto, signe que Hideo Kojima entend réellement prendre ses distances avec la série et la superviser de loin. Mais l’œuvre rattrape son créateur avec Metal Gear Solid 4 : Guns of the Patriots (sur PlayStation 3).
2)Le retour du créateur
Une fois de plus, Kojima déclare officiellement qu’il ne veut pas participer au développement du jeu, mais la pression des fans est immense, voire excessive. Il ne tarde pas à recevoir des menaces de mort, très sérieuses. L’équipe de développement est terrifiée et pour les rassurer, Kojima décide de rempiler. En 2008, l’année où sort Metal Gear Solid 4 : Guns of the Patriots, Kojima reçoit également une récompense au MTV Game Awards, pour l’ensemble de sa carrière. Carrière qu’il n’entend d’ailleurs pas arrêter de sitôt, comme il le déclare à la cérémonie de remises de prix. En 2009, il exprime son désir de collaborer avec un studio de développement étranger. Son choix se porte sur MercurySteam. Le titre final, Castlevania : Lords of Shadow sort en 2010.
3)Le chant du cygne ?
Parallèlement, Kojima a continué son travail sur la série Metal Gear en lançant le développement de Metal Gear Rising, un jeu centré sur le personnage de Raiden et orienté vers l’action pure. Mécontent du travail de ses équipes, Kojima décide de leur retirer le projet pour le confier au studio japonais PlatinumGames (MadWorld, Bayonetta). Cela donnera Metal Gear Rising Revengeance, sorti en 2013. Dans l’intervalle, Kojima a également repris les rênes du développement de Metal Gear Solid : Peace Walker sur PSP (2010), une fois de plus insatisfait du travail de ses équipes. Kojima concentre ensuite ses efforts sur le développement d’un nouveau moteur 3D, le Fox Engine. Il officialise en 2013 la création du premier titre basé sur ce moteur, Metal Gear Solid V…